En esta modalidad respiratoria, las ventanas nasales, izquierda y derecha, se usan independientemente, concentrándose de este modo las corrientes negativa y positiva del Prana, que fluye por el conducto nasal, derecho e izquierdo respectivamente. Su objetivo primordial es igualar y equilibrar estas corrientes en el cuerpo.
En su forma más sencilla, la respiración alterna consiste en respirar profundamente, primero por un conducto nasal, y luego por el otro. Sentados en cualquiera de las posiciones ya señaladas, con la columna vertebral muy erguida, se tapa la ventana derecha con el pulgar derecho, haciendo una aspiración lenta y completa por la ventana izquierda. Se retiene durante unos instantes la respiración, luego se cierra la ventana izquierda con los dedos tercero y cuarto de la mano derecha, y la espiración se efectúa lentamente por la ventana derecha.
Sigue una ligera pausa hasta que el impulso de aspirar se presenta de nuevo espontáneamente, se aspira por la ventana nasal derecha manteniendo la izquierda cerrada. Se retiene nuevamente la respiración durante un instante. La ventana nasal derecha se tapa ahora con el pulgar, se deja libre la izquierda, y la espiración se efectúa lentamente por el conducto izquierdo. Esto constituye un ciclo.